При проектировании удобно фрезе каждого вида сопоставить собственный слой. В системе проектирования RTUTILS слои, используемые для производства контрматриц, начинаются с префикса “RLM-“. При этом слой “RLM-B” используется для представления траектории цилиндрической фрезы для формирования биговальных каналов, слой “RLM-R” соответствует отрезной фрезе, слой “RLM-F” – фасочной, слой “RLM-T” – торцевой фрезе для формирования посадочных отверстий. Инициализация соответствующих слов Автокада при проектировании контрматриц производится путем установления соответствующего переключателя в диалоге процедуры инициализации RT-INIT-DLG.
Система проектирования RTUTILS включает в себя несколько утилит, предназначенных для использования в процессе проектирования контрматриц
Утилита RT-RILLMA-SYM 
используется для расстановки символов, соответствующих посадочным местам фиксирующих штифтов. Символы включают в себя части, предназначенные для размещения как на фанерном основании штанцевой формы, так и на чертеже контрматриц, поэтому удобнее всего размещать эти символы при проектировании штанцевых форм с последующим копированием информации с чертежа штанцевой формы. С помощью этой утилиты возможна вставка фиксирующих штифтов двух различных типов, а также замена типа ранее вставленных штифтов.
Утилита RT-RILLMA-LOGO 
предназначена для вставки служебной информации (номера заказа и логотипа фирмы) в чертеж контрматриц. Процедура вставки служебной информации в чертеж контрматриц аналогична процедуре вставки соответствующей информации в чертеж штанцевой формы.